Lorsqu'une loutre sauvage ayant désespérément besoin d'aide s'échoue sur sa jetée dans les îles écossaises isolées des Shetland, Billy, sa femme Susan et Jade, leur fidèle chien de berger, doivent accueillir ce nouveau membre très spécial dans leur famille. Billy et Molly est un documentaire réconfortant sur la capacité de l'amour à nous faire prendre conscience de la beauté de la nature.