Lupin III, petit-fils d'Arsène Lupin, le plus grand voleur du monde, marque l'histoire en dérobant des trésors de grande valeur aux quatre coins du monde, laissant une trace à leurs propriétaires. Compte tenu de son passé, il n'est pas surprenant qu'il soit la cible privilégiée des assassins les plus talentueux. Une invitation spéciale a été envoyée à Lupin et à son équipage pour une île inexplorée. L'invité serait le cerveau qui contrôle les meilleurs mercenaires du monde et serait lié à des crimes à travers le monde ! Qui pourrait bien être ce mystérieux individu ? La réponse se trouve sur cette île inexplorée, cachée à l'abri des regards. Pour découvrir l'identité du cerveau et dérober ses immenses richesses, Lupin et son équipage, ainsi que l'inspecteur Zenigata, dans sa tentative de les capturer, sont conduits sur cette île mystérieuse. L'île est entourée de mystères, notamment de vieux chars et armes à feu abandonnés, ainsi que d'étranges et mystérieux habitants. On dit que les assassins morts de son passé attendent Lupin et ses amis. Repoussant de nombreux assauts, Lupin finit par trouver le « cerveau » derrière tout cela. Il s'appelle « Muom » et son seul but est de purifier l'humanité sur Terre. Il cherche à éliminer Lupin qui l'empêche d'atteindre son objectif. Interférant avec la mission, Muom élimine rapidement ces assassins du passé qui cherchent à le traquer. L'immortalité de Muom le rend capable d'être brûlé vif et de résister à des balles en pleine tête. Derrière Muom, l'ombre d'un homme qui se fait appeler « Dieu » se profile en arrière-plan… C'est maintenant à Lupin de vaincre Muom pour sauver le monde, mais un brouillard toxique s'installe, lui imposant une limite de 24 heures pour survivre. Malheureusement, le corps de Lupin succombe lentement au poison… Dans une situation désespérée qui semble impossible, Lupin doit affronter le plus grand ennemi de sa vie !